紐約大都市區擁有美國最繁忙的機場系統，同時也是美國最主要國際門戶。紐約大都市區主要由三大機場提供服務，分別是約翰·f·肯尼迪國際機場(jfk)、紐瓦克自由國際機場(ewr)和拉瓜迪亞機場(lga)。
2018年，紐約三大機場共處理旅客1.38億人次，較2017年增長4.5%，較10年前(2009年)增長32%。
2018年夏天，紐約三大機場每天有3700個航班起降，平均每24秒就有一架飛機起飛或降落。在這些航班中，39%從肯尼迪機場起降，34%從紐瓦克起降，27%從拉瓜迪亞機場起降。
紐約多機場系統
肯尼迪國際機場(jfk)
肯尼迪國際機場位于紐約市皇后區，距曼哈頓30公里，是服務于紐約大都市區的主要國際機場，是北美最繁忙的國際航空客運門戶。jfk是世界上第22繁忙機場，也是美國第6繁忙機場，同時是紐約機場系統中最繁忙的機場。
2018年，jfk旅客吞吐量超過6190萬人次，年起降量達到了45.5萬架次。有近100家航空公司在該機場運營，飛往50個國際目的地。
jfk有六座航站樓，128個近機位，四條跑道(兩對平行跑道)，機場占地21平方公里。它是美國航空公司和達美航空公司的樞紐基地，也是捷藍航空公司的主要運營基地。
預計到2020年，該機場的年客運量將達到7500萬人次，到2050年將達到1億人次。
2018年10月，管理層公布了一項130億美元擴建計劃，將新建兩個國際航站樓。其中一個航站樓將由漢莎航空公司、法國航空公司、大韓航空公司和日本航空公司共同出資建設，造價70億美元，共有23個登機口。另一個耗資30億美元的航站樓將由捷藍航空開發。機場擴建項目預計將于2025年完工。