盡管物流系統(tǒng)是企業(yè)經(jīng)營管理系統(tǒng)的一部分，物流信息系統(tǒng)與企業(yè)其他的管理信息系統(tǒng)在基本面上沒有太大的區(qū)別，如集成化加模塊化、網(wǎng)絡(luò)化加智能化的特征，但物流活動本身具有的時空上的特點決定了物流信息系統(tǒng)具有自身獨特的特征。
（一）跨地域聯(lián)接
在物流活動中，由于訂貨方和接受訂貨方一般不再同一場所，如處理訂貨信息的營業(yè)部門和承擔貨物出庫的倉庫一般在地理上是分離的，發(fā)貨人和收貨人不在同一個區(qū)域等，這種在場所上相分離的企業(yè)或人之間的信息傳送需要借助于數(shù)據(jù)通訊手段來完成。在假期傳統(tǒng)的物流系統(tǒng)中，信息需要使用信函、電話、傳真等傳統(tǒng)手段實現(xiàn)傳遞，隨著信息技術(shù)進步，利用現(xiàn)代電子數(shù)據(jù)交換技術(shù)可以實現(xiàn)異地間數(shù)據(jù)的實時、無縫的傳遞和處理。
（二）跨企業(yè)聯(lián)接
物流信息系統(tǒng)不僅涉及企業(yè)內(nèi)部的生產(chǎn)、銷售、運輸、倉儲等部門，而且與供應(yīng)商、業(yè)務(wù)委托企業(yè)、送貨對象、銷售客戶等交易對象以及在物流活動上發(fā)生業(yè)務(wù)關(guān)系的倉儲企業(yè)、運輸企業(yè)和貨代企業(yè)等眾多的獨立企業(yè)之間有著密切關(guān)系，物流信息系統(tǒng)可以將這些企業(yè)內(nèi)外的相關(guān)信息實現(xiàn)資源共享。
（三）信息的實時傳送和處理
物流信息系統(tǒng)一方面需要快速地將搜集到的大量形式各異的信息進行查詢、分類、計算、儲存，使之有序化、系統(tǒng)化、規(guī)范化，成為能綜合反映某一特征的真實、可靠、適用而有使用價值的信息；另一方面，物流現(xiàn)場作業(yè)需要從物流信息系統(tǒng)獲取信息，用以指導(dǎo)作業(yè)活動，即只有實時的信息傳遞，使信息系統(tǒng)和作業(yè)系統(tǒng)緊密結(jié)合，克服傳統(tǒng)借助打印的紙質(zhì)載體信息作業(yè)的低效作業(yè)模式。