物流項目開展過程中會面臨很多的風險，這些風險都將直接或間接地威脅到項目開展的結果。在物流項目的建設和營運過程中，充分認識相關風險，并在實施過程中加以控制，大部分風險又是可以降低和防范的。
1、深入調查、科學預測，建立科學有效的決策機制
物流項目一般投資大、周期長、風險多，因此要深入調查研究分析市場需求，科學確定投資計劃，對項目的各種可能方案進行可行性論證，評估方案風險發生的概率和損失程度，權衡利弊，選出最優投資方案。投資決策作為整個投資過程始點起著根本性的作用，大量失敗的投資項目是由投資決策的失誤千百萬的。此外，要提高決策者的決策，建立科學有效的決策機制，杜絕和減少決策失識。
2、加強物流項目投資管理，增強抵御經營風險能力
物流項目投資方案一經選用，就應付諸實施。項目經營風險大小取決于項目獲利能力和投資回收能力。防范項目經營風險，一是應加快項目建設進度，節約項目投資，優質高效建　好項目。二是加強項目經營管理，增強其投資回收能力。三是加強項目財務收支管理，增強其投資回收能力，通過增加財務收入，節約財務支出，實現經營現金凈流量最大化，以達到盡快回收項目投資目的，從而有利于防范經營風險。
3、嚴格的制度管理
物流企業在營運過程中，通過嚴格的制度管理可以避免大部分風險。因此，要有嚴格的規章制度，將工作中出現的責任落實到個人，并結合相關的獎懲機制，將人為原因造成的失誤降到最低。對于可能出現問題的地方，應制訂專門的審核制度，將操作流程進行標準化處理，對整個物流服務制度化管理，保證物流系統的順暢營運。一方面要對信息系統和硬件設備進行專門的檢修和保養，避免硬件的故障造成物流服務環節中的差錯；另一方面服務流程盡量標準化，有章可循，減少人為原因造成的風險。
4、建立穩定的合作伙伴關系
物流項目開展初期，可以考慮強強聯合，降低風險，與有豐富管理經驗大型物流企業或相關行業的大型企業合資或合伙投資建設物流項目，這樣既可以降低投資風險，又能夠在合作中學習大型企業先進的管理經驗。首先將原有的簡單倉儲或運輸服務進行重組，形成一個有機整體，然后在穩定原有業務的基礎上發展新的業務，根據自身實業對目標客戶進行定位，積極尋找物流服務需求企業，經過與合作企業不斷溝通，了解客戶所需物流服務的具體內容，以及對物流設施的要求，考察該企業的物流服務需求是否在項目的服務能力內，如果符合要求，結合實際為客戶企業進行物流流程的設計，并與企業進一步切磋，最后制訂標準的服務流程后，簽訂長期物流服務合同，發展為穩定的合作伙伴關系，定期進行溝通，不斷改進工作中存在的不足，提高物流服務質量，以鞏固合作模式的穩定性。同時我們可以考慮采取與合作伙伴利益一體化的方式保證客戶的穩定性，密切關注客戶的資信狀況，對于資信狀況好、發展能力強的客戶，可考慮通過合資、相互控股的方式將物流項目的發展與生產企業緊密聯系起來，兩者相互依存，共同發展。