集裝箱運輸是將一定數量的單件貨物裝入標準規格的金屬箱內，以集裝箱作為運送單位所進行的運輸，可適用于海洋運輸、鐵路運輸及國際多式聯運。
集裝箱運輸有拼箱貨 (less than container load，lcl) 和整箱貨(full container load，fcl)之分。凡裝貨量達到每個集裝箱容積75%的或達到每個集裝箱負荷量 95%的即為整箱貨，凡裝貨量達不到上述整箱標準的，須按拼箱托運。
拼箱貨是裝不滿一整箱的小票貨物。該種貨物通常是由承運人分別攬貨并在集裝箱貨運站或內陸貨運站集中，而后將兩票以上的貨物拼裝在一個集裝箱內，同樣要在目的地的集裝箱貨運站或內陸站拆箱分別交貨。對于這種貨物，承運人要負擔裝箱與拆箱作業，裝拆箱費用仍向托運人收取。承運人對拼箱貨的責任，基本上與傳統雜貨運輸相同。
整箱貨是托運人自行將貨物裝滿整箱以后，以箱為單位托運的集裝箱。這種情況在貨主有足夠貨源裝載一個或數個整箱時通常采用，除有些大的貨主自已置備有集裝箱外，一般都是向承運人或集裝箱租賃公司租用一定的集裝箱。空箱運到工廠或倉庫后，在海關人員的監管下，貨主把貨裝入箱內、加鎖、鋁封后交承運人并取得站場收據，最后憑收據換取提單或運單。