提高口岸物流效率是一個系統工程，不僅受到通關效率的影響，還與政策環境、物流設施、市場潛力、技術進步等方面的因素密切相關。中國物流與采購聯合會會長陸江認為，當前提高口岸物流效率尤其需要從以下幾個方面作出努力。
1、積極培育具有國際競爭能力的樞紐港口。從目前我國口岸物流的組織現狀分析，港口扮演著重要角色，無論在總量和效率方面均對口岸物流具有重要影響。聯合國貿易發展組織在評價港口在物流發展中的作用時指出，"隨著國際貿易的發展和貿易方法及運輸的現代化，港口由原先海陸交界的轉運點發展成為貿易供應中心。在有些港口這種新活動生成的港口收入，占全部收入的1/3以上。實質上第三代港口是以物流中心為載體，集國際商品、資本、技術等于一身的資源配置型港口。"
許多口岸城市建設了一批以市場信息為基礎，以產品配送為主業，以現代倉儲為配套，以多式聯運為手段，以商品交易為依托的大型多功能綜合物流中心或物流基地，并成為區域性的物流中心城市。
如廣州港在發展主業的同時，利用港口的優勢，興辦了水產品交易市場。青島港依托煤炭、原油、礦石、集裝箱四大支柱貨種的物流優勢，大力培育礦石、原油、煤炭及化肥、糧食等港口現貨市場和區域性航運交易所。從國際物流發展趨勢看，我國應積極培育具有國際競爭能力的大型樞紐港口，努力發揮其在推動我國現代物流跨越式發展中的重要作用。
2、改善口岸物流發展環境，為客戶提供一流的口岸物流管理服務。要進一步完善口岸物流相關的法律、法規，努力與國際慣例相銜接。要在加強海關進出口監管、提高口岸各項管理職能的同時，強化職能部門的服務意識，盡量簡化手續，提高效率，最大限度地方便客戶。當前要研究盡早推廣"口岸電子執法系統"，實現企業"網上報關"，簡化進出關手續，縮短通關時間，方便企業合法進出。
同時，對于口岸的其他各項管理，應該遵循"一個窗口"服務的原則，盡量使商檢、衛檢和動植檢在一個窗口內實施檢查、檢疫。要盡力縮短貨物口岸滯港時間，在出口退稅、外匯核查、核銷等金融管理方面也應盡可能為客戶著想，提高企業從事進出口貿易的積極性。要大力發展口岸保稅物流，以吸收周邊國家和地區的中轉物流貨源。
3、努力促進口岸物流的資源整合，積極培育國際一流的現代口岸物流服務市場。要引進市場機制，改善經營方式，緊緊圍繞用戶各種需求，提供優質高效和豐富多樣的口岸物流服務，特別是強化口岸物流的貨物集散功能，抓好集貨、存貨和配貨，努力培育一個完善的物流服務市場，以滿足口岸物流服務的需求。
要根據口岸的特點，加速物流產業結構調整，促進口岸物流資源整合，在對口岸物流全行業開展協調和前瞻性的規劃工作的基礎上，推進行業聯盟和企業聯合經營，逐步使物流業務向規模化、集約化方向發展，更大程度地發揮口岸物流的潛在綜合優勢。
要根據現代物流發展趨勢，大力培育社會化、專業化的第三方物流企業，努力將現代物流同商流、信息流、人才流、資金流緊密結合在一起，形成-個以第三方物流服務為核心的口岸物流綜合服務系統。
4.引入國外先進的信息流技術，建立口岸物流信息網絡，加快口岸物流信息化進程。信息技術是構成現代物流體系的重要組成部分，也是現代物流賴以生存的根本技術保障。要盡快建立口岸物流信息網絡，包括以物流流轉數據處理為主要功能的電子數據交換系統(edi)；以物流信息系統中信息收集、倉儲庫存控制為主要功能的條形碼系統(bar-coding)；以物流流程監控為主要功能的全球衛星定位系統(gps)。
在信息系統建設的基礎上，盡快建立一個公正的、高效的口岸物流共同數據(公共信息)交換平臺，以實現口岸物流信息資源共享的要求，提升口岸物流信息管理和服務水平。在口岸物流信息網絡建設的同時，充分運用各種物流新技術手段，大力發展ec(電子商務)物流和it(信息)物流，不斷提高口岸物流技術含量。