運輸成本主要受以下因素的影響，主要有：
1．載貨量
載貨量之所以會影響運輸成本，是因為與其他許多物流活動一樣，大多數運輸活動中存在著規模經濟。
2．輸送距離
輸送距離是影響運輸成本的主要因素，因為它直接對勞動、燃料和維修保養等變動成本發生作用。
3．裝載能力
裝載能力這一因素是指產品的具體尺寸及其對運輸工具（鐵路車、拖車或集裝箱）的空間利用程度的影響。
由于有些產品具有古怪的尺寸形狀，以及超重或超長等特征，通常不能很好地進行裝載，并因此浪費運輸工具的空問。
裝載能力還受到裝運規模的影響，大批量的產品往往能夠相互嵌套、便利裝載，而小批量的產品則有可能難以裝載。
4．貨物的疏密度
貨物的疏密度包括重量和空間方面的因素。既然運輸車輛實際消耗的勞動成本和燃料成本主要不受重量的影響，那么，貨物的疏密度越高，相對應的可以把固定運輸成本分攤到增加的重量上去，使這些產品所承擔的每單位重最的運輸成本相對較低。
一般來說，物流管理人員會設法增加貨物的疏密度，以便能更好地利用拖車的容積，使拖車能裝載更多數量的貨物。
5．責任
責任主要關系到貨物損壞風險和導致索賠事故。
承運人必須通過向保險公司投保來預防可能發生的索賠，否則有可能要承擔任何可能損壞的賠償責任。
托運人可以通過改善保護性包裝，或通過減少貨物滅失損壞的可能性，降低風險，最終降低運輸成本。
6．裝卸搬運
卡車、火車或船舶等的運輸可能需要特別的裝卸搬運設備。
此外，產品在運輸和儲存時實際所采用成組方式（例如，用帶子捆起來、裝箱或裝在托盤上等）也會影響到搬運成本。
7．運輸供需因素
運輸通道流最和通道流量均衡等運輸供求方面的市場因素也會影響到運輸成本。理想的情況就是“平衡”運輸，即運輸通道兩端流最相等。
但由于制造地點與消費地點的需求不平衡，通道兩端流量相等的情況很少見。