盡管我國在物流標準化方面已做了很多工作，但仍然存在著很多問題，突出表現在以下兩個方面：
1）在物流標準化的操作方面，我國目前還沒有制定物流標準化的發展規劃以及物流標準化體系，尚未制定物流標準化總體規范，物流術語、物流設備、物流作業以及物流系統的建立規范化程度低，非標準化的物流裝備、設施、信息表示和信息交換仍然相當普遍，采用國際標準和國外先進標準的比例低。在實際操作中，存在著有標準而得不到承認和推廣，標準的推廣應用差，以及已有標準應用不好等問題。這些問題主要是由于物流標準化意識淡薄、物流市場發育不足、物流標準化人才缺乏以及體制性障礙所造成的。
2）由于長期受計劃經濟體制的影響，我國物流管理體制混亂，各地區、行業各自為政，沒有統一的物流標準化歸口單位。物流各分系統的標準往往由不同的政府部門制定，缺乏統一的規范，非常不利于物流系統各環節的有效配合和銜接，難以進行物流的系統化管理。
3）我國物流標準化發展建議
從物流標準化所包含的三個層次的內容可以看出，物流標準化的目的就是協調和理順物流各分系統之間，以及物流系統與其它相關系統之間的關系，保障物流環節暢通，最終達到降低物流成本，提高經濟效益，提高我國物流業國際競爭力的目標。
通過前面對我國物流標準化存在問題的分析，目前我國物流標準化發展的最大阻礙就是體制性障礙。由于我國物流管理存在著嚴重的條塊分割現象，致使各物流節點獨自開發的信息系統普遍都存在著結構差異。因此，物流標準化的核心任務應該是為這些異構的信息系統建立統一的信息平臺，并在此基礎上建立高效率的多式聯運體系和物流管理的協同工作機制。也就是借助現代物流的核心技術，主要是計算機網絡和信息等先進技術，將原本分離的采購、運輸、倉儲、代理、配送等物流環節，以及資金流、信息流、實物流等進行統一的協調控制，實現完整的供應鏈管理。將原屬于不同行業部門、不同產業領域的，運作體系相對獨立的節點物流信息系統進行有效的整合，提高整個物流供應鏈的運作效率。這項工作只有在政府的大力支持下，才能有效地展開。
目前，我國現代物流業的發展剛剛起步，遠遠落后于發達國家，而物流標準化的發展更是遠遠落后于物流業，嚴重影響我國現代物流業的發展。尤其是現在我國已加入國際貿易組織，為了建立高效率的物流體系，實現我國物流與國際物流的順利接軌，增強我國物流業的國際競爭力，必須把物流標準化工作提到前所未有的高度上來，從戰略的高度看待物流標準化工作，對物流標準化進行深入的研究，推動我國物流業的發展。