世界貿易組織共設立了以下幾個機構： （一）部長會議，由所有成員方的代表組成，是世界貿易組織的最高決策機構，它負責履行世界貿易組織的各項職能，并為此采取必要的行動。部長會議有權對有關多邊貿易協議的事項作出決定。部長會議至少每兩年召開一次會議。 （二）總理事會，也由各成員方代表組成，是世界貿易組織的常設決策機構，在部長會議休會期間執行部長會議的各項職能。總理事會下設3個專門理事會，即“貨物貿易理事會”、“服務貿易理事會”和“與貿易有關的知識產權理事”。 （三）部長會議下設的專門委員會： 1. 貿易與發展委員會，負責與發展中國家特別是最不發達國家有關的事務； 2. 國際收支限制委員會，負責在一成員方根據《1994關貿總協定》第12條和第18條為解決其收支平衡困難而采取貿易限制措施時，協調該成員方與其他成員方之間的關系； 3. 預算、財務與行政管理委員會，負責世界貿易組織財政和預算方面的事務。 上述各委員的成員從所有成員的代表中產生。 （四）秘書處，是世界貿易組織的日常辦事機構，由總干事領導。總干事的人選由部長會議任命，其權力、職責、服務條件和任期也由部長會議決定。