集裝箱碼頭堆場的主要業務工作是辦理集裝箱的裝卸、轉運、裝箱、拆箱、收發、交接保管、堆存、捆扎、掏載、搬運、以及承欖貨源等。此外，還應洽辦集裝箱的修理、沖洗、熏蒸和有關衡量等工作。
1．　集裝箱的交接
發貨人和集裝箱貨運站將由其或其代理人負責裝載的集裝箱貨物運至碼頭堆場時，設在碼頭堆場大門的門衛對進場的集裝箱貨物核對訂艙單、碼頭收據、裝箱單、出口許可證等單據。同時，還應檢查集裝箱的數量、號碼、鉛封號碼是否與場站收據記載相一致。箱子的外表狀況，以及鉛封有無異常情況，如發現有異常情況，門衛應在碼頭收據欄內注明，如異常情況嚴重，會影響運輸的安全，則應與有關方聯系后，決定是否接受這部份貨物。對進場的集裝箱，堆場應向發貨人、運箱人出具設備收據。
2．　制定堆場作業計劃
堆場作業計劃是對集裝箱在堆場內進行裝卸、搬運、貯存、保管的安排，這是為了經濟、合理的使用碼頭堆場和有計劃的進行集裝箱裝卸工作而制定。堆場作業計劃的主要內容有：
(1)確定空箱、實箱的堆放位置和堆高層數；
(2)裝船的集裝箱應按先后到港順序、集裝箱的種類、規格，載重的輕、重分別堆放；
(3)同一貨主的集裝箱應盡量堆放在一起。
3．　集裝箱的裝船
為了能在最短時間內完成裝船工作，碼頭堆場應在船舶到港受載前，根據訂艙單，先后到港的卸箱順序，制定出船舶積載圖和裝船計劃，等船靠泊后，碼頭堆場根據碼頭收據和裝箱單，按裝船計劃裝船。裝船完畢后，由船方在裝箱單、碼頭收據、積載圖上簽字，作為確認貨物裝船的憑證。
4.　對特殊集裝箱的處理
對堆存在場內的冷藏集裝箱應及時接通電源，每天還應定時檢查冷藏集裝箱和冷凍機的工作狀況是否正常，箱內溫度是否保持在貨物所需要的限度內，在裝卸和出入場內時，應及時解除電源。
對于危險品集裝箱，應根據可暫時存放和不能存放兩種情況分別處理。能暫存的貨箱應堆存在有保護設施的場所，而且堆放的數量不能超出許可的限度。對于不能暫存的貨箱應在裝船預定時間內，進場后即裝上船舶。
5．　與船公司的業務關系
集裝箱碼頭應保證：
(1)根據船期表提供合適的泊位；
(2)船舶靠泊后，及時提供足夠的勞力與機械設備，以保證船舶速遣；
(3)提供足夠的場所，作為集裝箱作業及堆存之用；
(4)適當掌握和注意船方設備，不違章操作。
船公司應保證：
(1)向碼頭確保船期，在船舶到港前一定時間提出確實到港通知。如發生船期改變，則應及時通知碼頭；
(2)裝船前2-10天左右提供出口貨運資料，以滿足堆場制定堆場計劃、裝船計劃之需要；
(3)應及時提供船圖，以保證正常作業。如船公司不能按時提供有關資料，則有失去靠泊的可能。
船公司與碼頭堆場的主要業務有：
(1)收、發箱作業以及其附屬業務；
(2)繕制設備收據、簽署場站收據；
(3)裝、卸箱作業，以及船邊至堆場之間的搬運、整理等工作；
(4)繕制裝、卸箱清單、積載圖報送代理公司；
(5)接受裝、拆箱貨物的作業，繕制裝箱單；
(6)有關集裝箱的堆存、轉運、沖洗、熏蒸、修理等事項。