物流業務管理系統由十一個子系統組成，分別是：倉儲管理系統、配送管理系統、運輸管理系統、貸代管理系統、報關管理系統、采購管理系統、結算管理系統、合同管理系統、客戶關系管理系統、數據交換系統。
１．配送管理信息系統
按照即時配送（jit）原則，滿足生產企業零庫存生產的原材料配送管理，滿足商業企業小批量多品種的連鎖配送管理，滿足共同配送和多級配送管理。支持在多供應商和多購買商之間的精確、快捷、高效的配送模式。支持以箱為單位和以部件為單位的靈活配送方式。支持多達數萬種配送單位的大容量并發配送模式；支持多種運輸方式，跨境跨關區的跨區域配送模式。結合先進的條碼技術，gps/gis技術，電子商務技術，實現智能化配送。
２．貨代管理信息系統
滿足國內一級貨運代理的要求，完成代理貨物托運、接取送達、訂艙配載、多式聯運等多項業務需求，支持航空、鐵路、公路和船務運輸代理業務。配合物流的其他環節，實現物流的全程化管理，實現門對門，一票到底的物流服務。
３．倉儲管理信息系統
可以對所有的包括不同地域、不同屬性、不同規格、不同成本的倉庫資源，實現集中管理。采用條碼、射頻等先進的物流技術設備，對出入倉貨物實現聯機登錄、存量檢索、容積計算、倉位分配、損毀登記、簡單加工、盤點報告、租期報警和自動倉租計算等倉儲信息管理。支持包租散租等各種租倉計劃，支持平倉和立體倉庫等不同的倉庫格局，并可向客戶提供遠程的倉庫狀態查詢、帳單查詢、和圖形化的倉儲狀態查詢。
４．運輸管理信息系統
可以對所有運輸工具，包括自有車輛和協作車輛的以及臨時的車輛實行實時調度管理，提供對貨物的分析，配載的計算，以及最佳運輸路線的選擇。支持全球定位（gps）和地理圖形系統（gis），實現車輛的運行監控、車輛調度、成本控制和單車核算。并提供網上車輛以及貨物的跟蹤查詢。
５．結算管理信息系統
對企業所有的物流服務項目實現合同價格一條龍管理，包括多種模式的倉租費用、運輸費用、裝卸費用、配送費用、貨代費用、報關費用、三檢費用、行政費用、辦公費用等費用的計算，根據規范的合同文本、貨幣標準、收費標準自動產生結算憑證，為客戶以及物流企業（倉儲、配送中心、運輸等企業）的自動結算提供完整的結算方案。
６．客戶管理信息系統
通過對客戶資料的收集、分類、存檔、檢索和管理，全面掌握不同客戶群體、客戶性質、客戶需求、客戶信用等客戶信息，以提供最佳客戶服務為宗旨，為客戶提供方案、價格、市場、信息等各種服務內容，及時處理客戶在合作中遇到的各類問題，妥善解決客戶合作中發生的問題，培養長期的忠誠的客戶群體，為企業供應鏈的形成和整合提供支持。
７．報關管理信息系統
集報關、商檢、衛檢、動植物檢疫等功能的自動信息管理于一體，滿足客戶跨境運作的需求。系統支持聯機自動生成報關單、報檢單，自動產生聯機上報的標準格式，自動發送到相關的職能機構，并自動收取回執，使跨境物流信息成為無縫物流信息傳遞，使報關、報檢業務迅速、及時、準確，為物流客戶提供高效的跨境物流服務。
８．數據交換信息系統
系統提供電子商務化的web-edi數據交換服務，通過電子商務網站或者基于internet的數據交換通道，提供標準的edi單證交換，實現與供應鏈上下游合作伙伴之間的低成本的數據交換，為供應鏈企業數據交換、電子商務數據交換以及未來開展電子支付、電子交易創造條件。
９．合同管理信息系統
合同是商務業務和費用結算的依據，系統通過對合同的規范化、模式化和流程化，合理地分配物流服務的實施細則和收費標準，并以此為依據，分配相應的資源，監控實施的效果和核算產生的費用，并可以對雙方執行合同的情況進行評估以取得客戶、信用、資金的相關信息，交客戶服務和商務部門作為參考。
１０．采購管理信息系統
采用規范化的企業采購模式和管理流程，滿足企業開放式或供應鏈采購方式，包括網上招標、供應商管理、采購計劃管理、需求管理、報價管理、審批管理、合同管理、訂貨管理、補貨管理、結算管理、信用管理、風險管理等功能，從成本降低、效率提高和流程控制等不同方面為企業創造價值。
１１．調度管理信息系統
用于大型物流企業的業務集中調度管理，適用于網狀物流、多址倉庫、多式聯運、共同配送、車隊管理等時效性強，機動性強、需要快速反應的物流作業管理，以應付客戶的柔性需求，減少部門之間的溝通環節，保證物流作業的運作效率。
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